Akcja gry zaczyna się kilka miesięcy po wydarzeniach z pierwszej części. Quincy Sharp, były naczelnik zakładu Arkham, po przypisaniu sobie zasług Batmana został mianowany burmistrzem Gotham. Jedną z jego pierwszych decyzji było wykupienie znacznej części lokalnych slumsów, wyrzucenie z nich normalnych mieszkańców, ogrodzenie terenu, a następnie wpuszczenie tam zbirów z Arkham. O dziwo, zamiast się nawzajem powyrzynać lokatorzy tego nietypowego więzienia zgrupowali się w kilka gangów i każdym z nich dowodzi jeden klasyczny łotr z komiksów o Batmanie. Z ramienia burmistrza całym tym terenem zarządza tajemniczy szaleniec znany jako Hugo Strange. Daje on więźniom pełną swobodę, a jedyną regułą jest zakaz podejmowania prób ucieczki.

Minimalne wymagania:

System operacyjny: Windows XP/ Vista / Windows 7 
Procesor: Intel Core 2 Duo 2.4 GHz lub AMD Athlon 64 X2 4800+
Pamięć RAM: 2 GB
Karta graficzna:  512 MB VRAM (Nvidia GeForce 8800 lub AMD Radeon HD3850)
Miejsce na dysku: 17 GB